清湖潘氏的来源，据《潘氏姓源》记载：“我祖出于季孙，系轩辕黄帝之后也。黄帝乃 有熊国君少典之子，姓公孙名轩辕”。“长于姬水，又姓姬”。……“西伯（指商朝西伯侯 姬昌）十四子毕公高，佑武王（周武王姬发，公元前1066年建立周朝）定天下，封于毕（今 陕西省西安、咸阳两市以北的谓河沿岸地区）。康王立（指周朝第三代国君姬钊），保厘 （即守卫、治理）东郊，毕公之四子季孙食采于潘（今河南省荥阳市），故以潘为姓，以商 为音，以荥阳为郡”。
清湖潘氏开基祖原寿公之祖父念一郎公，原居汀洲府城（今福建省长汀县）。元灭宋后， 曾 率兵抗元的念一郎公（宋末曾任南澳总兵），分别隐居于广州右卫、南雄上朔、莞邑学前等 地。至明初洪武年间，原寿公（明初洪武年间进士、官授潮州潮阳县儒学）才从当时的莞邑 学前迁至清湖。
清湖有两座潘氏宗祠：一座是建于明初的旧屋潘氏宗祠；另一座是建于“清康乾盛世” 时期的大围潘氏宗祠。
清湖旧屋的潘氏宗祠，坐东朝西，前有鱼塘，后靠林木葱茏的高坡，面对东丫湖。此祠 因建 于立村之初，开基祖原寿公为官清廉，资金有限，建得较为简朴，没有多大特色。祠堂共分 前后两进，砖木结构。此祠堂在上世纪50年代后期，曾作过学校使用。
清湖大围潘氏宗祠，门前有一口大鱼塘，后面有高坡，坡上有古荔园、古榕和灌木林。 祠 堂面宽68米，深18米；砖木结构，以红褚石作墙基，灰塑船形脊梁，上有彩陶雕塑鳌鱼 狮 子等装饰（“文革”中被毁坏）。分前后两进，前堂与后堂之间有天井；天井旁边有个侧门 通往厨房 ；前堂门前有两条红石檐柱，门内左右两边各有耳房；前堂内有两条硬木圆柱；头门上有“ 掷 果盈车”（潘安貌美的典故）横额，两侧有“宋朝昭武列”（指宋初开国功臣潘美）、“晋 代著文封”（指晋代大文学家潘岳及其侄潘尼）的对联；后堂敞开，前端有红石檐柱及内柱 两条支撑，上方正中悬挂“敬思堂”3个金字的木牌匾（此匾“文革”中被毁坏）。瓦檐有 瓦当封口，檐眉雕花，架梁浮雕花卉图案，工艺精良。最近一次维修在1934年。 清湖两座潘氏宗祠，在上世纪40年代，曾作为东江纵队铁东大队的驻地之一。清湖能 在解放初期被确定为东莞的革命老区，也与这两座祠堂有密切关系。
上世纪40年代初，中国共产党领导的华南抗日武装——东江纵队，为更好地发动和组织 群众抗击 日寇，成立了铁东大队，经常在广九铁路石龙到樟木头以东、东江以南石排、企石、桥头一 带活动。清湖，由于地处湖滨丘陵地区，山岭众多，林木茂密，利于隐蔽；且民风淳朴，群 众基础甚好，利于保密；加上村庄偏离圩镇有五六公里，距敌伪据点较远，村内又有旧 屋、大围两间祠堂（内有厨房）可以用作驻地，因而被铁东大队选为一个重要的活动基地。 据原铁东大队一些老游击队员和清湖村一些老人反映，铁东大队长谢阳光、政委卢克敏 在1944年多次率游击队员入驻清湖大围潘氏宗祠。谢大队长、卢政委一般住在前厅的东耳 房，西耳房作为游击队编印战报或油印宣传资料的地方，其他队员多数在后堂两厢“打地 铺”（人多时，也有一部分游击队员住到旧屋潘氏宗祠里）。铁东大队打了胜仗之后，曾多 次 在大围潘氏宗祠召开庆功祝捷大会，给游击队员们加个菜，改善一下生活，进行总结和休整 。铁东大队一些伤病员，亦曾留在大围潘氏宗祠疗伤养病。清湖大围潘氏宗祠，成为东纵铁 东大队一个可靠的后方基地。
1944年3月至8月间，铁东大队曾两次攻入企石，缴了伪联防队的枪，摧毁了敌伪政 权。而曾经参加这两次战斗的一个小队，当时就驻在清湖大围潘氏宗祠里。
1945年2月27日的早上，日军五十五航空师团所属的军用第七号飞机，载着从安南（越南 ）PnomPenh开会回来的侵华日军大佐安田利嘉雄及其随员，因机械故障在潼湖迫降。铁东大 队 闻 讯派出两个小队前往围歼日寇。日寇沿石马河堤且战且退，后在河边抢了一只木船，顺流而 下，企图逃往下游石龙的日军据点。游击队员从两岸夹击日寇，终于将安田利嘉雄大佐、八 田 顺作大尉等8名日军官兵及飞行员全歼于船上。这一仗，共缴获八九式陆空两用机枪两挺、 步枪两支、短枪12支、指挥刀3把，以及无线电收、发器各1副、军事秘密资料一批。战 斗一结束，游 击队员就从石马河边沿山间小道撤离战场，在松林、果园的隐蔽下，进入清湖大围的潘氏 宗祠（据说，缴获的两挺机关枪因目标太大，游击队员们在清湖大围东面附近的猪牯岭上， 找到一个长满杂草的旧坟穴，把两挺机枪暂时藏进去，并留下一名队员在附近看管）。当天 黄昏，日伪军立即从樟木头至石龙的广九铁路沿线，集结大量兵力，对潼湖、桥头、企石一 带的村庄进行大规模“扫荡”，逐村逐户搜查，有不少村民被打伤，有的村民被杀害。而清 湖由于离主干道较远，日伪军没有进村逞凶。当晚，铁东大队在清湖大围潘氏宗祠里杀鸡加 菜，开了一个庆功大会，游击队员们兴高采烈，清湖的父老乡亲吐气扬眉，整个大围潘氏宗 祠内洋溢着一派庆贺胜利的气氛。